발간사  ... 3
화보  ... 9
제1부 과거청산의 의의와 현황
 과거청산과 의무사진상규명  ... 21
 한국의 과거청산  ... 46
 외국 진실위원회의 활동과 교훈  ... 71
제2부 2기 의문사진상규명위원회의 활동과 평가
 2기 위원회의 구성과 활동  ... 101
 의문사진상규명위원회 활동과 평가  ... 117
 참고 : 기관별 비협조(협조) 현황  ... 146
제3부 1기 권고 시행결과와 2기 권고
 1기 권고 시행결과와 평가  ... 157
 2기 위원회 권고  ... 167
참고
 사인확인제도 개선방안  ... 181
 사인확인기관의설립·운영및육성에관한법률안  ... 192
 현행 국가기록보존의 문제점과 개선방향  ... 205
부록
 1. 활동일지  ... 221
 2. 위원·직원 명단  ... 233
 3. 자문위원회 위원명단  ... 239
 4. 의문사진상규명에관한특별법  ... 241
 5. 의문사진상규명에관한특별법시행령  ... 254
 6. 의문사진상규명위원회 각종 규정  ... 262