발문 : 차령 이남을 넘어 동아시아의 맥으로  / 김지하 ... 4
프롤로그 : 조선 천재들은 왜 새로운 세상을 꿈꾸었는가? ... 6
제1부 천재들이 벌인 참혹한 전쟁
   1. 한 통의 비밀 장계 : 눈물을 흘린 이유로 죽은 자들, 조대중과 김빙 ... 17
   2. 선비들의 시대, 대격돌의 시대 : 승려들의 희생, 서산대사와 사명당 ... 34
   3. 천재 중의 천재, 정여립 : 그를 천거한 두 사람의 비극, 노수신과 백유양 ... 51
   4. 돌이킬 수 없는 배신 : 그가 배신한 두 스승, 이이와 성혼 ... 71
   5. 선조의 두 얼굴 : 선조의 왼팔과 오른팔, 유성룡과 이항복 ... 101
   6. 상소 공방전과 대동계의 비밀 : 죽이는 자와 죽는 자, 정철과 최영경 ... 132
   7. 얼굴 없는 주인공 : 얼음과 불의 엇갈린 운명, 송익필과 이발 ... 192
   8. 죽음의 고발자 : 최대의 피해자들, 정언신과 정언지 ... 233
   9. 선조가 지시를 내리다 : 당의 운명을 걸고 맞서다, 이산해와 조헌 ... 265
   10. 정철의 몰락 : 사제 간의 비참한 말로, 박순과 정개청 ... 296
제2부 비망록 : 기축옥사의 숨겨진 진실을 찾아서
   1. 실패한 혁명인가 억울한 옥사인가 ... 330
   2. 논쟁의 불꽃이 튀다 ... 334
   3. 반역의 고향에 관한 이야기들 ... 356
   4. 아름다운 꿈, 대동 ... 370