목차 일부
서론 ; 물리학 및 화학과 제법칙과 세포 ... 3
유전은 거대분자를 통해 작업한다 ... 3
단백질은 아미노산 사슬로 되어 있다 ... 4
비공유결합력은 단백질 형태에 중요하다 ... 8
단백질 구조는 극히 다양하다 ... 9
단백질은 어떻게 올바른 형태를 취하게 되는가? ... 12
제1부 DNA : 정보의 저장소 ... 15
1장 유전자 :...
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목차 전체
서론 ; 물리학 및 화학과 제법칙과 세포 ... 3
유전은 거대분자를 통해 작업한다 ... 3
단백질은 아미노산 사슬로 되어 있다 ... 4
비공유결합력은 단백질 형태에 중요하다 ... 8
단백질 구조는 극히 다양하다 ... 9
단백질은 어떻게 올바른 형태를 취하게 되는가? ... 12
제1부 DNA : 정보의 저장소 ... 15
1장 유전자 : 돌연변이의 단위 ... 17
유전자의 발견 ... 19
유전에 대한 염색체의 역할 ... 23
각 유전자는 개개 염색체의 어느 한 부위에 위치한다 ... 27
유전자는 직선성 배열을 하고 있다 ... 28
유전자 지도는 연속적이다 ... 32
1개 유전자 - 1개 단백질 ... 32
상세한 정의 : 시스트론 ... 34
분자수준에서 돌연변이 지도를 작성한다 ... 37
2장 DNA : 유전물질 ... 40
DNA의 발견 ... 41
DNA는 보편적인 유전물질이다 ... 42
DNA의 성분 ... 45
DNA는 이중나선이다 ... 46
DNA복제는 반보존적이다 ... 52
유전암호는 3중자로 잃혀진다 ... 55
점 돌연변이는 염기쌍 1개를 변화시킨다 ... 57
돌연변이는 hotspot에서 집중적으로 일어난다 ... 59
돌연변이의 비율 ... 60
3장 핵산의 위상기하학 ... 62
DNA는 변성되고, 재변성 될 수 있다 ... 62
핵산은 염기짝 형성에 의해 혼성체화 된다 ... 63
단일가닥 핵산은 2차구조를 가진다 ... 65
역반복과 2차구조 ... 67
이중가닥 DNA는 여러 종류의 이중나선 구조를 가진다 ... 70
DNA의 좌선성 형태 ... 73
닫힌 DNA는 초과도로 꼬일 수 있다 ... 74
초과도 꼬임은 이중나선의 구조에 영향을 미친다 ... 76
4장 유전자의 단리 ... 78
제한효소들은 DNA를 특이적인 조각으로 절단한다 ... 80
조각에서 제한지도를 조립한다 ... 81
제한자리는 유전자 표지를 이용할 수 있다 ... 85
DNA결합순서를 얻는다 ... 90
원핵생물의 유전자와 단백질은 공직선이다 ... 94
진핵생물 유전자는 중단될 수 있다 ... 96
어떤 DNA결합순서는 하나 이상의 단백질을 지정한다 ... 97
유전정보는 RNA 또는 DNA에 들어있다 ... 98
패러다임(Paradigm)의 범위 ... 102
제2부 유전자와 단백질 ... 105
5장 단백질 합성 조립 공정 ... 107
전달 RNA는 adaptor이다 ... 108
전령 RNA는 리조소옴에 의해 번역된다 ... 109
유전암호의 의미 ... 114
리보소옴의 작용자리 ... 116
개시에 30S 하위단위체와 부속인자들이 필요하다 ... 118
폴리펩티드 합성에 특수한 개시 tRNA가 필요하다 ... 120
진핵생물 개시에 많은 인자들이 관여한다 ... 123
신장인자 T는 aminoacye - tRNA A자리로 옮긴다 ... 125
자리옮김에 의해 리보소옴이 이동한다 ... 128
종료 : 3개의 코돈이 단백질합성을 종료시킨다 ... 131
6장 전달 RNA : 번역 ADAPTOR ... 133
보편적인 크로버잎 구조 ... 134
3차 구조는 L자형이다 ... 134
합성효소가 어떻게 tRNA를 인식하는가? ... 137
결합단계에서의 식별 ... 139
코돈 - 역코돈 인식은 동요와 관계있다 ... 142
tRNA는 변형된 염기를 많이 가지고 있다 ... 144
염기 변형에 의해 코돈 인식이 조절된다 ... 146
미토콘드리아는 최소의 tRNA 집합을 가진다 ... 148
돌연변이체 tRNA는 다른 코돈을 읽는다 ... 149
억제돌연변이 tRNA는 그들의 코돈과 경쟁한다 ... 152
tRNA는 읽는 구조에 영향을 미친다 ... 154
7장 리보소옴 번역 공장 ... 156
리보소옴은 치밀한 ribonucleoprotein 입자이다 ... 157
리보소옴 단백질은 rRNA와 상호작용한다 ... 159
In vitro 재구성은 invivo조립과 비슷하다 ... 162
하위단위체 조립은 위상기하와 관련있다 ... 163
모든 리보소옴 성분들은 돌연변이 될 수 있다 ... 165
리보소옴은 여러개의 활성중심을 가진다 ... 166
번역의 정확도 ... 169
8장 전령 RNA 주형 ... 172
박테리아 전령의 일시성 ... 172
박테리아 mRNA는 대부분 다시스트론성이다 ... 174
다시스트론성 전령의 번역 ... 176
박테리아 mRNA에 대한 기증적 정의 ... 178
In vitro 번역시스템의 능력 ... 179
대부분의 진핵생물 mRNA는 3'말단에서 polyadenyl화 된다 ... 181
모든 진핵생물 mRNA는 5'말단에 메칠화된 모자를 가지고 있다 ... 183
개시는 mRNA와 rRNA간의 염기쌍 형성과 관계있다 ... 185
작은 하위단위체는 진핵생물 mRNA상의 개시자리로 이동한다 ... 186
단백질합성은 세포의 한 위치와 결합되어 있다 ... 188
제3부 전사와 유전자 발현의 조절 ... 195
9장 RNA중합효소와 촉진유전자 상호작용 및 전사의 조절 ... 197
전사는 RNA중합효소에 의해 촉매된다 ... 197
박테리아 RNA중합효소는 응어리 효소와 시그마 인자로 되어 있다 ... 199
많은 하위단위체로 구성된 진핵생물 RNA중합효소 ... 202
시그마인자는 DNA와의 결합을 조절한다 ... 204
전사단위는 촉진유전자에서 종료유전자까지이다 ... 206
촉진유전자에 consensus 결합순서가 있다 ... 207
RNA 중합효소는 in vitro에서 촉진유전자와 결합할 수 있다 ... 210
시그마 인자의 치환에 의해 개시가 조절된다 ... 216
RNA중합효소 Ⅱ에 대한 촉진유전자는 출발점의 상류에 있다 ... 221
RNA중합효소 Ⅱ 촉진유전자는 여러 부분으로 나누어져 있다 ... 225
전사인자들은 특정 consensus결합순서들을 인식한다 ... 228
강화유전자는 개시를 보조하는 양쪽 방향성 요소이다 ... 230
RNA중합효소 Ⅲ는 하류 촉진유전자를 가지고 있다 ... 233
10장 오페론 : Lactose 패러다임 ... 236
유발과 억제는 소분자에 의해 조절된다 ... 236
구조유전자 집략은 협조적으로 조절된다 ... 237
억제인자 단백질이 작동유전자와 결합한다 ... 240
작동유전자는 cis 작용성이다 ... 242
어떻게 억제인자 단백질이 전사를 차단하는가? ... 243
작동유전자에서의 접촉 ... 245
억제인자 단백질은 다합체성 DNA결합 단백질이다 ... 247
DNA에서 분리되어 잉여의 억제인자 단백질이 축적된다 ... 249
유발의 모순 ... 252
여러자리가 억제될 수 있다 ... 252
양의 조절과 음의 조절 ... 254
분해산물 억제는 촉진유전자에서 양(+)의 조절과 관계있다 ... 256
곤경은 절략반응을 일으킨다 ... 259
번역은 스스로 조절된다 ... 261
적은 RNA분자들은 번역을 조적할 수 있다 ... 264
11장 종료와 전사의 조절: 감쇠 및 항종료 ... 268
E.coli의 두개의 종료 양식이 회문과 관계있다 ... 269
진핵생물 종료도 2차구조 또는 U- 연속 부분이 관련된다 ... 270
또 하나의 2차구조가 감쇠를 조절한다 ... 272
감쇠의 일반성 ... 278
E.coli rho 인자는 어떻게 작용하는가? ... 280
항종료는 특이적인 자리에 좌우된다 ... 283
RNA중합효소에 더 많은 하위단위체가 있는가? ... 288
12장 분해 폭포 및 용원성 억제 ... 291
분해(lysis) 폭포 ... 292
파아지 T7 및 T4 기능에 집락화 ... 294
람다 분해폭포는 항종료에 의존한다 ... 297
용원성은 자기발생적 회로에 의해 유지된다 ... 299
억제인자는 각 작동유전자와 협력적으로 결합하는 이합체이다 ... 302
억제인자 단백질 합성은 어떻게 확립되는가? ... 308
분해감염을 위해서는 항억제인자 단백질이 필요하다 ... 311
미세한 균형 : 용원성 대 분해(용균) ... 313
제4부 DNA복제 ... 317
13장 REPLICON : 복제의 단위 ... 319
연쇄적인 복제로 눈(eyes)이 형성된다 ... 320
박테리아 게놈은 하나의 replicon이다 ... 321
복제와 세포주기(cell cycle) ... 323
진핵생물 염색체는 많은 replicon을 가진다 ... 325
효모 replicon 기원의 분리 ... 327
복제의 눈, rolling circle 또는 고리를 통해 진행할 수 있다 ... 329
플라스미드 불공존성은 사본 수와 관련있다 ... 330
14장 DNA복제장치 ... 336
DNA중합효소 : DNA를 만드는 효소 ... 337
DNA합성은 반불연속적이다 ... 341
Okazaki조각은 RNA에 의해 합성이 개시된다 ... 342
박테리아 복제장치의 복잡성 ... 343
단일 DNA가닥의 합성개시 ... 344
Primosome의 이동 ... 347
이중 기원에서의 복제개시 ... 350
파아지 T4의 복제장치 ... 355
선형 replicon의 문제 ... 357
15장 DNA 보호시스템 ... 360
제한 및 변형의 효과 ... 361
유형Ⅰ효소의 다른 활성 ... 363
유형Ⅲ효소의 이중(dual) 활성 ... 366
DNA의 손상을 취급한다 ... 367
E.coli의 삭제 - 수선시스템 ... 370
E.coli의 재조합 수선시스템 ... 372
많은 유전자의 SOS시스템 ... 373
포유류 수선시스템 ... 376
제5부 진핵생물 게놈 ... 377
16장 놀라운 힘 : DNA공학 ... 379
어떠한 DNA결합순서라도 박테리아에서 클론될 수 있다 ... 379
키메라 DNA를 조립한다 ... 381
mDNA에서 DNA를 만든다 ... 384
게놈에서 특정 유전자를 분리한다 ... 386
염색체를 따라 걸어간다 ... 389
진핵생물 유전자는 원핵생물 시스템에 의해 발현될 수 있다 ... 391
17장 결합순서의 연속체와 구조유전자 ... 395
C값 모순은 게놈의 크기가 크게 변한다는 것이다 ... 395
재결합 운동학은 결합순서 복잡성에 좌우된다 ... 397
진핵생물 게놈은 여러가지 결합순서 성분을 가진다 ... 399
비반복성 DNA복잡성으로 게놈 크기를 예측할 수 있다 ... 400
진핵생물 게놈은 반복성 결합순서를 가진다 ... 401
보통의 반복성 DNA는 많은 상이한 결합순서로 되어 있다 ... 402
반복성 결헙순서 군(群)의 구성원을 관련되어 있으나 동일하지 않다 ... 404
대부분의 구조유전자는 비반복성 DNA에 위치한다 ... 405
비반복성 유전자의 얼마가 발현되는가? ... 407
RNA추진반응의 운동에 의해서 유전자 수를 예측한다 ... 409
유전자는 여러가지 수준으로 표현된다 ... 411
mRNA 집단간의 중첩 ... 411
18장 중단된 유전자의 조직 ... 414
유전자들의 모양과 크기는 극히 다양하다 ... 415
rRNA 및 tRNA를 지정하는 유전자의 intron ... 418
Exon-intron결합부위는 consensus결합순서를 가진다 ... 419
한 유전자의 intron은 다른 유전자의 exon이 될 수 있다 ... 420
중단된 유전자는 어떻게 진화했는가? ... 422
제6부 관련된 결합순서들의 집락 ... 429
19장 구조유전자와 가족 ... 431
글로빈 유전자는 두개의 집락으로 되어 있다 ... 432
부등교차에 의해 유전자 집락이 재배열된다 ... 434
대부분의 지중해 빈혈증은 부등교차의 결과이다 ... 436
유전자 집락을 연속적인 재조직화를 받는다 ... 438
DNA에서 두 자리가 결합순서 분화에 의해 구별된다 ... 439
진화시계로 글로빈 유전자의 발달과정을 추적할 수 있다 ... 441
의사유전자는 진화의 종말단계이다 ... 442
유전자 가족은 풍부한 단백질의 경우 일반적으로 나타난다 ... 444
여러가지 일렬 반복유전자 집락이 히스톤을 지정한다 ... 445
rRNA 및 tRNA 유전자들은 반복된다 ... 448
일렬로 반복하는 단위는 두 종류의 rRNA유전자 함유한다 ... 449
5S유전자와 의사유전자는 내부 분산되어 있다 ... 452
진화상의 모순: 복수의 활성유전자 사본이 어떻게 유지되는가? ... 453
20장 세포 소기관 게놈 ... 456
세포 소기관 유전자는 멘델식으로 유전하지 않는다 ... 456
세포 소기관 게놈은 원형 DNA분자이다 ... 457
세포소기관은 그들 자신의 유전자를 표현한다 ... 459
효모의 큰 미토콘드리아 게놈 ... 461
포유류의 치밀한 미토콘드리아게놈 ... 462
재조합은 세포소기관 DNA에서 일어난다 ... 464
효모 미토콘드리아 DNA의 재배열 ... 465
21장 단순 결합순서 DNA의 조직 ... 467
고도로 반복성인 DNA는 위성 DNA를 구성한다 ... 468
위성 DNA는 대부분 이질염색질에 있다 ... 469
절족동물 위성 DNA는 매우 짧은 동일한 반복들로 되어 있다 ... 470
포유류 위성은 계층적으로 반복되어 있다 ... 471
마우스 위성 DNA 진화의 단계를 재구성한다 ... 473
현 반복단위의 변이들 ... 475
부등교차의 결과 ... 476
교차 고정은 동일한 반복을 유지시킬 수 있다 ... 478
제7부 성숙화 : RNA가공 ... 481
22장 안정한 RNA의 절단 및 정비 ... 483
RNA aseⅢ는 파아지 T7 초기 mRNA를 방출시킨다 ... 486
원핵생문 및 진핵생물 rRNA는 전구물질이 절단되어 만들어진다 ... 488
tRNA는 여러가지 효소에 의해 전달되고 정비된다 ... 492
23장 촉매제로써 RNA: 이어맞추기 메카니즘 ... 496
효모 tRNA 이어맞추기는절단과 재결합에 의해 이루어진다 ... 497
RNA는 촉매활성을 가질 수 있다 ... 499
어떤 미토콘드리아 intron은 스스로 이어맞추는 intron과 관련되어 있다 ... 504
조절인자 단백질을 지정하는 intron ... 507
핵 RNA 이어맞추기는 우선적인 경로를 따른다 ... 511
핵 이어맞추기 겨합부위는 서로 교환 될 수 있다 ... 513
핵 spliceosome은 고리를 만든다 ... 515
snRNA가 이어맞추기와 관련있는가? ... 519
이어맞추기 반응은 관련되어 있는가? ... 521
24장 RNA가공의 조절 ... 524
hnRNA는 크고, 불안정하다 ... 524
hnRNA가 mRNA로 된다 ... 526
polyadenyl화와 3'말단의 형성 ... 528
전사 후에도 조절되는가 ... 530
유전자 발현의 조절에 관한 모델 ... 533
세포 polyprotein의 능력 ... 536
제8부 DNA 체움 ... 539
25장 게놈과 염색체 ... 541
비루스 게놈을 응축시켜 외피에 채워넣기 ... 542
박테리아 게놈: nucle oid ... 545
간기 염색질과 유사분열기 염색체간의 비교 ... 549
분리 장치로서 진핵생물 염색체 ... 552
일부 유전자는 염색체외의 분자에 존재한다 ... 555
Lampbrush 염색체의 퍼진(extended) 상태 ... 556
다사염색체는 거대 염색체를 형성한다 ... 558
전사는 염색체 구조를 교란한다 ... 560
26장 염색질 구조 : 뉴클레오솜 ... 562
염색질의 단백질 성분 ... 563
뉴클레오솜은 모든 염색질의 염기성 하위단위체이다 ... 564
응어리 입자는 고도로 보존되었다 ... 567
DNA는 히스톤 8합체 주위에 꼬여있다 ... 569
초나선화와 DNA의 주기성 ... 574
뉴클레오솜은 phase로 배열되는가? ... 575
염색질 섬유사에서 뉴클레오솜의 경로 ... 578
고리(loop), 영역(domain)그리고 골격(scaffolds) ... 579
27장 활성 염색질의 성질 ... 583
뉴클레오솜 조립과 염색질 복제 ... 584
뉴클레오솜 조립에 비히스톤성 단백질이 필요하다 ... 586
전사되는 유전자들은 뉴클레오솜에서 조직되는가? ... 587
전사가능한 염색질의 DNAase 감수성영역 ... 590
히스톤은 일시적으로 변형된다 ... 592
유전자 발현은 탈메칠화와 관련되어 있다 ... 595
DNA ase에 고도로 감수성인 자리에 의해 염색질 구조가 변한다 ... 598
DNA구조의 유연성 ... 602
유전자 활성화의 성질에 관한 고찰 ... 604
제9부 게놈의 역동성: DNA의 변화 ... 607
28장 DNA의 재조합 및 기타 위상기하학적 조작 ... 609
재조합은 상동성 이중가닥 DNA의 synapsis를 필요로 한다 ... 610
절단과 재결합은 이질 이중가닥 DNA가 포함된다 ... 611
이중가닥 절단이 재조합을 개시할 수 있는가? ... 614
재조합 중간체의 단리 ... 616
Rec A의 가닥교환시설 ... 617
Rec A와 재조합 상태 ... 620
유전자 전이에 의해 대립인자간 재조합이 밝혀진다 ... 623
DNA의 위상기하학적 조작 ... 625
선회효소는 DNA에 음성의 초나선을 도입한다 ... 628
특수화된 재조합은 특이적 자리를 인식한다 ... 629
응어리 내에서의 엇갈린 절단 및 재결합 ... 631
역위에 의해 유전자 발현이 조절된다 ... 634
29장 박테리아의 자리옮김 요소 ... 637
삽입결합순서는 단순한 transposon이다 ... 638
혼성 transposon은 IS module을 가진다 ... 640
Tu 10 module 중 하나만 기능적이다 ... 642
Tu 10 module은 거의 동일하나 매우 다르다 ... 644
보존적 재조합 대 복제성 재조합 ... 646
자리옮김의 중간산물 ... 648
30장 진해생물의 이동성 요소 ... 654
옥수수의 조절요소는 자리 옮김 할 수 있다 ... 654
Ds는 자리를 이동하거나 염색체 절단을 일으킨다 ... 656
Ds 자리옮김은 복제와 관련된다 ... 569
Retrovirus 라이프 싸이클은 자리옮김 같은 사건과 관계있다 ... 660
Retrovirus는 세포 결합순서를 형질도입 시킨다 ... 664
RNA 의존성 자리옮김은 세포에서 일어날 수 있다 ... 666
Alu군(family) ... 667
효모 Ty요소는 retrovirus와 닮았다 ... 668
머리 종류의 자리옮김 요소가 D.melanogaster에 존재한다 ... 670
잡종 생식장애에 대한 자리옮김 요소의 역할 ... 672
31장 게놈의 공학적 변화 ... 676
조직 특이적 변이가 Drosophila 게놈에서 일어난다 ... 677
증폭된 게놈 결합순서의 선택(도태) ... 679
외인성 결합순서는 transfection에 의해 도입될 수 있다 ... 683
transfection된 DNA는 생식세포 속으로 들어갈 수 있다 ... 685
제10부 발육과 유전자 ... 689
32장 재배열과 면역 다양성의 발생 ... 691
면역글로블린의 조직 ... 692
면역글로블린 유전자는 그들의 구성부분으로부터 조립된다 ... 695
Germ-line 정보의 다양성 ... 698
결합반응에 의해 추가적으로 다양성이 부여된다 ... 699
V와 C유전자의재조합에 의해 결실과 재배열이 일어난다 ... 700
대립인자 배척의 일부 원인들 ... 704
다음 단계의 DNA재조합은 종류 전환을 일으킨다 ... 705
초기의 무거운 사슬 표현은 RNA가공에 의해 변할 수 있다 ... 707
체세포 돌연변이로 다양성이 더 커진다 ... 710
T세포 수용체는 면역글로블린과 관계있다 ... 708
주요 조직친화성 자리의 복잡성 ... 711
33장 유전자 조직의 변화 ... 715
효모는 교미형을 위해 비활성 자리와 활성자리를 가지고 있다 ... 715
비활성 및 활성 카세트는 동일한 결합순서를 가진다 ... 718
한쪽방향 자리옮김은 수여 MAT자리에 의해 개시된다 ... 720
Trypanosome은 DNA를 재배열하여 표면 항원을 표현한다 ... 722
Ti 플라스미드 DNA와 식물 게놈의 상호작용 ... 727
34장 유전자 규제: 발현 패턴의 변화 ... 733
Exon과 intron의 돌연변이 지도를 작성한다 ... 734
Drosophila 발생에 관한 기본 지식 ... 737
복합자리는 굉장히 크며, 규제와 관련된다 ... 742
공통적인 지정 motif:homeo box ... 748
35장 암유전자 : 비정상적인 유전자 표현과 암 ... 751
형질전환 비루스는 종양유전자를 가진다 ... 752
Reteovirus 암유전자는 그와 대응하는 세포유전자가 있다 ... 754
Ras proto-oncogene은 돌연변이에 의해 활성화 될 수 있다 ... 757
Myc와 다른 암유전자는 삽입, 자리옮김 그리고 증폭에 의해 활성화된다 ... 760
불멸화와 형질전환 ... 765
암단백질의 예상 기능등 ... 767
맺음말 ... 773
찾아보기 ... 777
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